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PubPeer 评论梳理

PubPeer 评论梳理 | 神经元轴突与动脉平滑肌细胞间突触样传递驱动脑神经血管耦合

本文仅梳理 PubPeer 公开评论的观点,不代表最终结论,也不代表该论文已被撤稿或官方认定存在问题。
原论文:Synaptic-like transmission between neural axons and arteriolar smooth muscle cells drives cerebral neurovascular coupling. Nature Neuroscience, 2024.
DOI:10.1038/s41593-023-01515-0 PMID:38168932 ISSN:1097-6256
第一作者:Dongdong Zhang(张东东)
第一作者单位:复旦大学生命科学学院,上海;浙江大学生长调控与转化研究重点实验室/西湖大学生命科学学院,杭州;西湖高等研究院基础医学研究所神经血管生物学实验室,杭州;西湖实验室生命科学与生物医学,杭州;西湖大学生命科学学院神经血管生物学实验室,杭州。
通讯作者:Jie-Min Jia(贾洁敏)
评论:2 条评论,2026 年 5 月—9 月

太长不看版

  • 评论者指出,Fig. 1 正文报告的 NsMJ 数量(491)与源数据各工作表计数(502、241、321)不一致;Fig. 1k 源数据中存在一个 24 个值的重复数据块,且该重复块对报告的汇总统计量产生了影响;Fig. 8d 源数据中两列(AP 和 AQ)143 个时间点数值完全相同。
  • 评论者还指出 Fig. 1j 中囊泡类型百分比之和不为 100%(分别为 112%、96%、89%),以及 Fig. 1l–p 中关键的 CLEM 证据仅基于 n = 1 个 NsMJ。
  • 通讯作者 Jie-Min Jia 回应:已就上述所有问题向 Nature Neuroscience 提交更正。对于重复问题,一处是在制作 Excel 表格时误将一组数据复制了两次;另一处是对同一神经元信号作用于两根相邻血管的影响进行了测量,经与专业统计学家商议后,应仅将一根神经元信号用于一根血管。作者表示这些更正不影响研究结论。

2024 年发表于 Nature Neuroscience 的一项研究提出,单个谷氨酸能轴突通过神经-动脉平滑肌细胞连接(NsMJ)上的突触样传递使供血小动脉扩张,从而驱动脑神经血管耦合。2026 年 5 月,PubPeer 上出现质疑评论;2026 年 9 月,通讯作者作出回应。以下按评论编号梳理各方观点,供读者自行判断。


评论 #1:Fig. 1 与 Fig. 8 源数据不一致与重复值

评论者 Viburnum carlesii 指出,源数据中若干不一致和明显的重复值需要作者澄清,并列出以下五个方面:

【1】Fig. 1 中 NsMJ 报告数量与源数据计数不一致

正文中作者陈述:“仅在这三条穿透小动脉中观察到 491 个 NsMJ”,Fig. 1h–k 则被呈现为对这些三条穿透小动脉中 NsMJ 特征的定量分析。然而,Fig. 1 的源数据文件似乎与此数字不一致。

在源数据文件 41593_2023_1515_MOESM13_ESM.xlsx 中:

因此,正文和图例中报告的 NsMJ 数量与用于不同 Fig. 1 测量的源数据条目数量似乎并不匹配。评论者表示,希望作者澄清 Fig. 1h、Fig. 1i 和 Fig. 1k 的实际 n 值,并解释这些数字与论文所述 491 个 NsMJ 之间的关系。

【2】Fig. 1k 源数据中疑似重复数据块

在源数据文件 41593_2023_1515_MOESM13_ESM.xlsx 中,工作表“Fig. 1k”似乎存在一个由 24 个连续值组成的重复数据块。单元格 A248:A271 中的值与 A299:A322 中的值完全相同:

60, 90, 60, 100, 160, 40, 100, 50, 100, 120, 60, 100,
130, 210, 290, 100, 120, 90, 150, 130, 150, 290, 170, 110

该重复块被包含在已发表的 Fig. 1k 源数据中。使用 Fig. 1k 源数据中全部 321 个值计算得到:均值 = 199.545,标准差 = 90.930。这些值与 Fig. 1k 中显示的均值 199.5 和 s.d. 90.93 相对应。如果移除重复块 A299:A322 的第二份拷贝,数据集变为 n = 297,均值变为约 205.64。因此,该重复块似乎对报告的汇总统计量产生了影响。评论者询问 A248:A271 与 A299:A322 是否对应不同的生物学/结构测量,或者其中一个块是否在源数据准备过程中被意外复制。

【3】Fig. 8d 源数据中疑似重复轨迹

在源数据文件 41593_2023_1515_MOESM20_ESM.xlsx 中,工作表“Fig. 8d”的合并标题“Spreading depolarization of SMACreER:Grin1f/f SD (▵F/F0)”下的两列 AP 和 AQ 似乎完全相同。具体而言,单元格 AP2:AP144 和 AQ2:AQ144 包含 143 个完全相同的时间点值。

例如,两列中的前 10 个值为:

-0.01018, -0.00513, -0.00204, 0.003259, -0.0074,
0.007888, 0.023843, -0.01098, -0.00231, 0.013512

两列中的后 5 个值为:

0.929831, 0.843642, 0.893651, 0.910248, 0.909956

如果 AP 和 AQ 代表两个独立的动物、血管、ROI 或实验试次,那么 143 个时间点的完全一致将高度出乎意料。如果它们代表同一轨迹因其他目的而被有意复制,源数据文件并未明确说明这一点。评论者询问 AP 和 AQ 对应什么,以及两列是否都作为独立轨迹被纳入分析。

【4】Fig. 1j 囊泡类型百分比可能存在歧义

在源数据文件 41593_2023_1515_MOESM13_ESM.xlsx 中,工作表“Fig. 1j”列出了三条穿透小动脉的囊泡类型百分比:

正文描述了基于突触囊泡特征的两个 bouton 亚型,约 80% 含有小电子透明囊泡,约 20% 含有致密核心囊泡。如果这些类别是互斥的,各小动脉的百分比之和应约为 100%。如果它们并非互斥,则应予以澄清,因为“两个亚型/类别”的措辞可能产生误导。

【5】关键的 Glu-NsMJ CLEM 证据仅基于 n = 1 个 NsMJ

Fig. 1l–p 的 CLEM 示例是“Thy1-YFP 阳性谷氨酸能轴突在体内与 aSMC 形成 NsMJ”这一主张的核心证据。该图图例注明“n = 1 NsMJ”。评论者指出,这不是源数据重复问题,但与证据强度相关。鉴于 Glu-NsMJ 对论文模型的核心重要性,了解是否有通过 CLEM 独立鉴定的其他 Glu-NsMJ 被观察到但未展示,以及原始 CLEM 配准/分割数据是否可用,将是有帮助的。

评论者总结

评论者认为最令人担忧的源数据问题是:


评论 #2:通讯作者回应

通讯作者 Jie-Min Jia(贾洁敏)于 2026 年 9 月作出回应。作者表示,已就评论中提出的所有问题向 Nature Neuroscience 提交了更正(correction)。对于主要的重复问题,作者说明:一处是在制作 Excel 表格时,确实误将一组数据复制了两次;另一处是对同一神经元信号作用于两根相邻血管的影响进行了测量,经与专业统计学家商议后,认为应仅将一根神经元信号用于一根血管。作者表示这些更正不会改变研究结论。

更正声明要点:

  • 已向 Nature Neuroscience 提交更正。
  • 重复数据块之一:制作 Excel 表格时误将一组数据复制了两次。
  • 重复轨迹:测量了同一神经元信号对两根相邻血管的影响,经统计学家建议后应仅保留一根血管的数据。
  • 作者认为更正不影响研究结论。

总结

本次 PubPeer 评论的核心质疑集中在源数据层面:Fig. 1 正文报告的 NsMJ 数量(491)与源数据各工作表计数(502、241、321)不一致;Fig. 1k 源数据中存在一个 24 个值的重复数据块,且该重复块对报告的汇总统计量产生了影响;Fig. 8d 源数据中两列(AP 和 AQ)143 个时间点数值完全相同;Fig. 1j 中囊泡类型百分比之和不为 100%;关键的 CLEM 证据仅基于 n = 1 个 NsMJ。

通讯作者 Jie-Min Jia 回应称,已就所有问题向 Nature Neuroscience 提交更正。对于重复问题,作者承认一处是制作 Excel 表格时误将一组数据复制了两次,另一处是同一神经元信号被用于两根相邻血管,经统计学家建议后应仅保留一根血管的数据。作者表示更正不影响研究结论。

这些质疑与更正最终应如何评价,需由期刊、同行评议及后续独立验证来裁决。本梳理仅呈现 PubPeer 公开评论与作者回应的内容。

参考来源

原论文:Zhang D, Ruan J, Peng S, et al. Synaptic-like transmission between neural axons and arteriolar smooth muscle cells drives cerebral neurovascular coupling. Nature Neuroscience, 2024, 27(2):232-248. DOI: 10.1038/s41593-023-01515-0. PMID: 38168932.

PubPeer 评论页面: https://www.pubpeer.com/publications/B17AE69A124624C3E279433961AADC

评论者:Viburnum carlesii(评论 #1,2026 年 5 月);通讯作者 Jie-Min Jia(评论 #2,2026 年 9 月)。


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